Tại các tỉnh đồng bằng, đi tới đâu quân Pháp cũng vấp phải sự kháng cự của nhân dân ta . Ở Thái Bình , có căn cứ kháng chiến của cha con ông Nguyễn Mậu Kiến . Tại Phong Doanh (Ý Yên,Nam Định) ,có căn cứ kháng chiến của Phạm Văn Nghị...
Thấy lực lượng của địch ở Hà Nội tương đối yếu , quân ta khép chặt vòng vây . Ngày 21-12-1873 , khi quân Pháp đánh ra Cầu Giấy , chúng đã bị đội quân của Hoàng Tá Viêm phối hợp với quân Cờ đen của Lưu Vĩnh Phúc phục kích. Gác-ni-e cùng nhiều sĩ quan thực dân và binh lính bị giết tại trận .
Chiến tháng Câu Giấy khiến quân Pháp hoang mang , còn quân dân ta thì phấn khởi , càng hăng hái đánh giặc .
Giữa lúc đó, triều đình Huế lại ký với thực dân Pháp Hiệp ước Giáp Tuất (15-3-1874) .Theo đó quân Pháp sẽ rút khỏi Bắc Kỳ, còn triều đình thì chính thức thừa nhận sáu tỉnh Nam Kỳ hoàn toàn thuộc Pháp .
Hiệp ước năm Giáp Tuất đã làm mất một phần quan trọng chủ quyền lãnh thổ ngoại giao và thương mại của Việt Nam.