Cấu trúc bậc 1: là trình tự sắp xếp các aa trong chuỗi pôlipeptit.
VD: Chuỗi axit amin mạch thẳng gồm 30 axit amin
Cấu trúc bậc 2: là chuỗi pôlipeptit bậc 1 có câu trúc xoắn hình lò xo.
VD; Chuỗi axit amin xoắn alpha cấu tạo nên insulin.
Cấu trúc bậc 3: do cấu trúc bậc 2 uốn khúc đặc trưng cho mỗi loại prôtêin.
VD: Enzim A được cấu tạo từ 1 chuỗi axit amin có cấu trúc không gian ba chiều tạo thành trung tâm hoạt động gắn với cơ chất.
Cấu trúc bậc 4: do nhiều cấu trúc bậc 3 kết hợp thành khối cầu.
VD: Hemoglobin gồm 4 chuỗi polipeptit cấu tạo nên.
