Xét riêng từng cặp tính trạng ta có:
Thân cao x thân thấp aa → $\frac{1}{2}$ thân thấp aa = $\frac{1}{2}$a x 1a → Cây thân cao đem lai tạo giao tử $\frac{1}{2}$a nên cây thân cao là Aa.
Chín sớm x chín muộn bb → $\frac{1}{2}$ chín muộn bb = $\frac{1}{2}$b x 1b → Cây chín muộn đem lai tạo giao tử $\frac{1}{2}$b nên cây thân cao là Bb.
→ Cây thân cao, chín sớm dị hợp 2 cặp gen.
Mà ta thấy không tạo kiểu hình thân cao, chín muộn A_bb và thân thấp chín sớm aaB_
→ Có hiện tượng liên kết gen hoàn toàn.
Vậy kiểu gen bố mẹ: $\frac{AB}{ab}$ x $\frac{ab}{ab}$