- Cấu tạo:
+ Trùng biến hình: đơn bào gồm có chất nguyên sinh lỏng và nhân, không bào co bóp, ko bào tiêu hóa.
+ Trùng giày: đơn bào gồm có nhân lớn nhân nhỏ, ko bào co bóp, ko bào tiêu hóa, hầu và miệng (dù là đơn bào nhưng đã phân hóa thành các bộ phận cụ thể)
- Di chuyển:
+ Trùng biến hình: chân giả
+ Trùng giày: lông bơi
- Dinh dưỡng:
+ Trùng biến hình: thức ăn là vụn hữu cơ, tảo, vi khuẩn,..
+ Trùng giày: thức ăn là vi khuẩn vụn hưu cơ, vi khuẩn
- Sinh sản:
+ Trùng biến hình: Vô tính
+ Trùng giày: Vô tính và hữu tính