Nhiệt độ nước thường phụ thuộc vào nhiệt độ không khí nhưng mức độ biến thiên chậm hơn nhiệt độ không khí và ở các khu vựclớn khác với quy luật của các khu vực nhỏ. Nói chung nhiệt độ trong nước thường ổn định và điều hòa hơn trên cạn, biểu hiện rõ là về mùa lạnh, nước trong ao hồ càng dưới sâu càng ấm. Còn sang mùa nóng thì nước ở độ sâu lại mát hơn ở tầng mặt. Những nơi nhiều nước nếu nhiệt độ không khí xuống chỉ còn 00C – 70C nhưng nhiệt độ nước thấp nhất trong nước chỉ xuống khoảng 120C. Mùa hè nhiệt độ không khí lên đến 36 – 380C nhưng nhiệt độ nước chỉ lên 33 – 340C. Nhiệt độ nước cũng còn thay đổi theo ngày đêm.

Bởi vậy trong các ao hồ người ta thường thả bèo tây vào một góc ao để cho nắng mùa hè và ngăn bớt gió rét mùa đông. Người ta cũng thường thả những loài cá yếu chịu rét xuống các ao sâu để chống rét cho cá tôm

vì phần lớn thủy sản là động vật biến nhiệt nên khi nhiệt độ của nước cao hoặc thấp quá thì nhiệt dộ cơ thể của chúng cũng sẽ như vây , từ đó thủy sản sẽ sinh trưởng và phát triển kém