Ở Đồng bằng sông Cửu Long có một số khó khăn cho sự phát triển:
- Đất phèn, đất mặn chiếm diện tích lớn (khỏang 60 % diện tích của đồng bằng)
-Phải đầu tư lớn và mất nhiều thời gian để cải tạo.
- Mùa khô sâu sắc và kéo dài (nóng, ẩm, lượng mưa dồi dào từ tháng 11 đến tháng 4),
- Lũ lụt hàng năm diễn ra trên diện rộng gây ra nhiều thiệt hại.
- Chất lượng môi trường ở nhiều vùng suy thoái.
- Tài nguyên khoáng sản hạn chế, gây trở ngại cho việc phát triển kinh tế
-Thiếu nước ngọt cho sản xuất và sinh hoạt trên nhiều diện rộng
- Nạn xâm nhập mặn gây nhiều trở ngại đối với đời sống và sản xuất ở các vùng ven biển.
