Thuốc kháng sinh tác dụng vào các khâu khác nhau hoặc các bộ phận khác nhau đặc hiệu của vi khuẩn, do đó không làm tổn hại đến tế bào người, ví dụ:
- Thuốc kháng sinh tác động lên thành tế bào vi khuẩn, tế bào người không có thành này nên không bị tác động.
- Thuốc kháng sinh tác động lên ribosome của vi khuẩn ức chế chúng tổng hợp protein, ribosome của tế bào người khác với vi khuẩn.