Vì phân chuồng có nhiều thành phần có chất dinh dưỡng mà các chất dinh dưỡng thường ở dạng khó tiêu nên phải có thời gian để phân bón phân hủy thành các chất hòa tan
Hiện nay, việc bón phân chuồng tươi cho cây rất hạn chế và không nên bón trực tiếp cho cây trồng. Bởi vì trong phân chuồng không chỉ có các dinh dưỡng phù hợp cho cây. Nó còn chứa các loại nấm, vi sinh vật có trong thức ăn của gà, bò, heo hằng ngày.
