Người ta cần chọn tác nhân cụ thể khi gây đột biến vì mỗi loại tác nhân có khả năng tạo ra một hoặc một số lọai đột biến nhất định. Thí dụ loại hóa chất cosixin khi thấm vào mô đang phân bào sẽ cản trở hình thành thoi phân bào làm cho toàn bộ NST không phân li gây đột biến tạo thể đa bội hoặc có loại hóa chất chỉ tác động đến 1 loại nucleotic xác định, điều này hứa hẹn khả năng chủ động gây ra các loại đột biến mong muốn.
Bên cạnh đó mức độ tác dụng của mỗi loại tác nhân đột biến lên tế bào và mô cũng khác nhau. Thí dụ tia tử ngoại cũng có khả năng xuyên sâu vào mô như các tia phóng xạ.
Do vậy tùy theo mục đích của việc gây đột biến mà cần chọn tác nhân cụ thể phù hợp.