Tuy nhiên, trong thời gian qua, việc thực hiện nhiệm vụ này có rất nhiều khó khăn, vướng mắc, như lực lượng quân y của Bộ Tư lệnh thủ đô mỏng, tổ chức biên chế khác nhau, lại không có bệnh viện; chưa có xe chuyên trách vận chuyển.Bên cạnh đó, theo tướng Duyệt, giai đoạn 1 phòng ngừa các trường hợp về từ Trung Quốc, Hàn Quốc tốt, nhưng giai đoạn 2 từ đầu tháng 3 tới nay thì có biểu hiện lỏng ở một số điểm.Theo vị Tư lệnh Bộ Tư lệnh thủ đô, một số du học sinh ở khu vực châu Âu trở về nhìn chung con cháu của gia đình có điều kiện, nên khi về đến sân bay Nội Bài có hiện tượng một số thiếu hợp tác với cơ quan chức năng.“Một số phải dùng công an, an ninh hàng không gần như cưỡng chế cho lên xe thì mới vận chuyển được về các địa điểm cách ly”, tướng Duyệt nói, và cho biết vừa qua có thông tin quân đội không đủ phương tiện vận chuyển công dân từ sân bay Nội Bài về các khu cách ly là không chính xác.
