Khi sử dụng phép lai phân tích ta không thể xác định được qui luật tương tác của 2 cặp gen không alen.
Ví dụ 1 phép lai như sau: Aabb x aabb → 1/2Aabb : 1/2aabb
Tỉ lệ KH là 1 : 1 không thể xác định được là tuân theo quy luật tương tác nào, vì tương tác bổ sung hay tương tác cộng gộp đều sẽ phân li như vậy