Hiện tượng thoái hóa giống là hiện tượng khi tự thụ phấn hoặc giao phối cận huyết trong nhiều thế hệ, tỉ lệ thể đồng hợp tăng dần, tỉ lệ thể dị hợp giảm dần, tạo ra các cặp gen lặn đồng hợp gây hại.
Như vậy, hiện tượng thoái hóa xảy ra ở cả vật nuôi và cây trồng. Nếu cho các loài vật nuôi giao phối cận huyết nhiều thế hệ, cũng sẽ gây nên hiện tượng thoái hóa giống, do các cặp gen lặn đồng hợp gây hại xuất hiện ngày càng nhiều.