Vi khuẩn cổ là sinh vật nhân sơ, cấu trúc tương tự như vi khuẩn, chỉ có vài đặc điểm khác biệt:
- Thành tế bào không phải murein mà là Pseudomurein, thành phần acid N-acetyl muramic bị thay thế bằng N-talozaminuronic
- acid amine trong khởi đầu chuỗi polypeptide không phải formyl-methinonine là là methionine tương tự như nhân thực
-Nó còn là 1 dạng ester khác biệt
- Ngoài ra chúng sống ở điều kiện khắc nghiệt như núi lửa, suối nước nóng
- Khó tiêu diệt
