Điểm khác cơ bản của cuộc khởi nghĩa Yên Thế so với các cuộc khởi nghĩa trong phong trào Cần Vương được thể hiện ở ngay tên của phong trào và cuộc khởi nghĩa, đó là mục tiêu/mục đích đấu tranh.
+) Phong trào Cần Vương có mục tiêu / mục đích đấu tranh là đánh Pháp giành độc lập dân tộc, khôi phục lại chế độ phong kiến.
+) Khởi nghĩa nông dân Yên Thế có mục đích đấu tranh là đánh Pháp để tự vệ, giành quyền lợi thiết thân cho cuộc sống của nhân dân , giữ đất, giữ làng
