Vi sinh vật có thể là đơn bào hoặc đa bào.
Đây là danh từ không để chỉ đích danh một phân loại theo loài hay lớp nào chung. Mà nó dùng để chỉ tất cả các loài sinh vật có kích thước nhỏ bé, không nhìn được bằng mắt thường mà phải sử dụng kính hiển vi.
Vậy, dù đơn bào hay đơn bào, miễn chúng có kích thước đủ nhỏ thì đều được gọi là vi sinh vật