Nếu P thuần chủng khác nhau bởi n cặp tính trạng tương phản di truyền phân li độc lập. Tỉ lệ kiểu gen F2 khi cho các cá thể F1 giao phối hoặc tự thụ phấn với nhau là:
Xét riêng từng cặp tính trạng: P thuần chủng, F1 dị hợp 1 cặp gen thì F2 cho tỉ lệ KG là 1 : 2 :1.
Có n cặp tính trạng di truyền theo quy luật phân li độc lập, tích tỉ lệ phân li chung bằng tích tỉ lệ phân li riêng nên xét trên n tính trạng thì tỉ lệ kiểu gen ở F2 là: (1 : 2 : 1)n.