Phong trào Đông Kinh nghĩa thục có ảnh hưởng sâu sắc đến phong trào yêu nước chống pháp ở nước ta vào đầu thế kỉ XX:
-Nuôi dưỡng phong trào cách mạng trong lĩnh vực văn hóa, tư tưởng, theo khuynh hướng dân chủ tư sản.
-Là cuộc vận động chính trị chuẩn bị về tinh thần, tư tưởng cho sự nghiệp đấu tranh cách mạng dân tộc dân chủ trong thời đại mới.
-Nâng cao lòng yêu nước và chí tiến thủ cho quần chúng nhân dân.
-Truyền bá một nền tư tưởng, học thuật mới, một nếp sống mới, tiến bộ: chống nền giáo dục cũ, cổ vũ cái mới (học chữ Quốc ngữ), đả phá và lên án phong tục, tập quán lạc hậu.
-Tố cáo tội ác của thực dân Pháp, thức tỉnh đồng bào.
-Đóng góp một phần vào phong trào yêu nước đầu thế kỉ XX, hỗ trợ phong trào Đông du và cuộc vận động Duy tân.
