Gen sẽ quy định tổng hợp nên mARN, từ đó gián tiếp quy định nên trình tự axit amin trong chuỗi polipeptit
Đột biến gen làm thay đổi trình tự các nucleotit trên gen, dẫn đến thay đổi trình tự trên mARN, do đó làm thay đổi trình tự axit amin của chuỗi polipeptit. Từ đó làm thay đổi cấu trúc của protein.
Mà protein quyết định nên sự biểu hiện của tính trạng. Do vậy đột biến gen làm thay đổi biểu hiện của tính trạng tương ứng.