- Vì giao phối cận huyết dẫn tới hậu quả tăng tỉ lệ thể đồng hợp tử, trong đó các gen lặn có hại có nhiều biểu hiện. Điều này thường dẫn đến hiện tượng giảm đa dạng sinh học của quần thể dẫn đến giảm khả năng tồn tại và thích nghi của nó. Việc tránh bộc lộ những alen lặn có hại gây ra bởi giao phối cận huyết.
- VD: giun đất có 1 ngăn, loài cá có 2 ngăn, loài bò sát, lưỡng cu có 3 ngăn và con người có 4 ngăn.